Genómica y metagenómica: Secuenciación y análisis bioinformático

Curso desarrollado en colaboración con el Centro de Educación Continua de la Universidad Nacional Agraria La Molina.

El análisis de secuenciación genómica  implica emplear software avanzados para examinar y procesar datos de secuenciación de genomas. Esta técnica revela la secuencia exacta de nucleótidos en el ADN, desvelando información crucial sobre la función y estructura genética. Mediante herramientas y paquetes especializados, los investigadores pueden procesar los datos de secuenciación, realizando análisis bioinformáticos y estadísticos avanzados. Esta poderosa herramienta beneficia a expertos en genética, biología molecular, medicina y biotecnología, permitiéndoles obtener resultados precisos y reproducibles de manera eficiente. Adentrarse en esta metodología propulsa el entendimiento y avance en diversas áreas científicas.

¿Qué aprenderás en este curso?

En el curso  aprenderás sobre la estructura y diversidad genómica, explorando aplicaciones clave en genómica. Conocerás tecnologías de secuenciamiento de primera, segunda y tercera generación, sus usos y diferencias. Dominarás la extracción de ADN genómico, incluyendo aislamiento, cuantificación y purificación. Profundizarás en el ensamblaje de genomas: obtención y análisis de datos NGS, control de calidad, ensamblado de secuencias illumina y métricas de calidad. Aprenderás a validar ensamblajes, usar R para análisis y manipulación de datos genómicos, realizar mapeo y anotación de genomas, y explorar la fascinante metagenómica y biobarcoding.

Plus: Podrás aprender a tu ritmo desde cualquier lugar

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Fechas de inicio de clases:

Las clases tienen una duración de 4 semanas de manera online.

GRUPO 3 (7:30 pm hora Perú)

• Inicia: 15 de Julio del 2024
• Finaliza: 6 de agosto del 2024

(Vease el brochure pará  más detalles)

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¿Qué necesito?

Que necesito:

– Una laptop o computadors, una libreta pequeña de apuntes y lapicero.

-Una gran curiosidad y muchas ganas de aprender cosas nuevas e innovadoras

Certificado de 30 horas

Emitida por Centro de educación continua de la Universidad Nacional Agraria La Molina (UNALM) y Flyteek.

PhD(c) Luis Angel Chicoma Rojas

Egresado de la Universidad Privada Antenor Orrego (UPAO) en Ingeniería Agrónoma, Estudiante de Doctorado en Genética y Mejoramiento de Plantas en la Universidad Estatal Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (UNESP/FCAV), miembro del Laboratorio de Bioquímica de Micoorganismos y Plantas (LBMP), presidente del Grupo de Estudios en Genética y Mejoramiento de Plantas (GEMP – UNESP/FCAV), miembro de la Sociedad Peruana de Bioinformática y del Regional Student Groups– La Libertad asociado al International Society for Computational Biology.

MS (c) Francisco Ascue Orosco

Egresado de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos en Genetica y Biotecnologia, Estudio el posgrado de Computer Science con especialidad en Data Science y Machine learning en la Universdidad de ingenieria y Tecnologia (UTEC). Tiene conocimientos en analisis de datos de secuenciamiento (RNA-Seq, Genomica, Metagenomica, Metatranscriptomica, RADseq, etc), asi como en programacion (Python, R, C++, Java, etc)

Producción Científica

1. Rojas, L. A. C.; Farinacio, R.; Lemos, E. G. M. Identification And Measurement In
   Silico Of Protein Tunnels And Ligation Pockets Of The Cry3bb1 Insectile Toxin.. In:
   Encuentro Científico Internacional 2020 de invierno, 2020, Lima. Encuentro
   Científico Internacional 2020 de invierno, 2020.
2. Rojas, L. A. C.; Farinacio, R.; Lemos, E. G. M. Comparative Analysis Of The Three-
   Dimensional Structural Of The Cry23aa1 And Cry51aa1 Insectile Proteins Using Bioinformatic Tools. In: VIII Jornada Internacional de Investigación Científica -UNTUMBES, 2020, Tumbes.
3. Rojas, L. A. C.; Farinacio, R.; Lemos, E. G. M. Avaliação In Silico Das Interações
   Entre A Toxina Cry1ac1 E O Receptor Caderina De Populações De Helicoverpa
   Armigera Suscetíveis E Resistentes Encontradas Em Campo. In: 10o Congresso
   Brasileiro De Melhoramento De Plantas, 2019.
4. Felix, M. R.; Rojas, L. A. C.; Farinacio, R.; Lemos, E. G. M. Eficaz Acoplamento In
   Silico Da Toxina Mutante Cry8ka5 De Bacillus Thuringiensis E Receptores De
   Membrana Intestinal De Anthonomus Grandis. In: 12o Congresso Brasileiro de
   Algodão,2019.
5. Felix, M. R.; Rojas, L. A. C.; Farinacio, R.; Lemos, E. G. M. Eficiente Ensaio In Silico
   Para Predição De Ligação Entre O Receptor Aminopeptidase- N (Apn1) De
   Helicoverpa Zea E As Proteínas Cry1ac1 E Cry2ab1.In: 12o Congresso Brasileiro do
   Algodão, 2019, Goiânia. 12o Congresso Brasileiro do Algodão, 2019.

Proyectos de Investigación

1. Bioprospección de moléculas bioactivas de origen bacteriano con potencial uso en
   Control Biológico (2021 – Actual).
2. Caracterización del Microbioma Rizosférico de Ají Mochero (Capsicum chinense L.)
   como huella genética de La Libertad (2019 – 2020).
3. Prospección, caracterización funcional y estructural de enzimas lipolíticas de
   metagenomas marinos (2019 – 2020)
4. Estudio de estructuras tridimensionales y capacidad de unión de proteínas Cry de
   Bacillus thuringiensis (Bt) mediante herramientas bioinformáticas (2017 – 2017)

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