¿Qué aprenderás?

Este curso ofrece una formación práctica en análisis bioinformático de metagenómica bacteriana mediante la secuenciación del gen 16S rRNA, una herramienta ampliamente utilizada para estudiar la composición y diversidad de comunidades microbianas en muestras ambientales, agrícolas y otros sistemas de interés biotecnológico. Los participantes comprenderán los fundamentos de la secuenciación de amplicones y aprenderán cómo transformar datos de secuenciación en información útil para caracterizar comunidades bacterianas.

Se abordarán las principales etapas del flujo de análisis, incluyendo control de calidad de secuencias, filtrado de lecturas, eliminación de quimeras, asignación taxonómica y análisis de diversidad alfa y beta. Además, se revisará la construcción de perfiles de abundancia bacteriana, la comparación de comunidades entre muestras y la interpretación de resultados mediante tablas y visualizaciones. Se introducirán herramientas bioinformáticas utilizadas en este campo, como QIIME 2 y R, para procesar datos y explorar patrones en la composición microbiana.

Al finalizar, el estudiante será capaz de procesar e interpretar datos de secuenciación 16S, caracterizar comunidades bacterianas y comparar su diversidad y composición, aplicando herramientas bioinformáticas en proyectos de investigación en microbiología, ecología microbiana, agricultura y biotecnología.