En este programa aprenderás el flujo completo del análisis genómico moderno, desde los fundamentos teóricos hasta el procesamiento práctico de datos reales. Comenzarás comprendiendo qué son los genomas y las tecnologías de secuenciación de primera, segunda y tercera generación. Luego dominarás el trabajo de laboratorio con la extracción, cuantificación y purificación de ADN, y explorarás la metagenómica y el biobarcoding para el estudio de comunidades microbianas.

La parte central del programa es práctica: aprenderás a procesar datos NGS, realizar control de calidad, recortar y filtrar secuencias, analizar k-mers y ensamblar genomas a partir de datos Illumina. Después evaluarás la calidad de tus ensamblajes con métricas especializadas, descargarás secuencias del SRA-NCBI, mapearás lecturas contra genomas de referencia (Rbowtie), manipularás formatos SAM/BAM (Rsamtools) y finalizarás con el llamado de variantes y la anotación de genomas. Todo el análisis bioinformático se desarrolla en R, integrando los fundamentos de programación necesarios a lo largo del camino.

Requisitos: conocimientos básicos de biología molecular y genética. No se requiere experiencia previa en programación: los fundamentos de R se enseñan dentro del programa.